About the author Ana Garcia

Enhorabuena al grupo OLl-CNIO

El proyecto de investigación presentado por Manuel Palacín (IRB, Barcelona) en colaboración con el grupo de Oscar Llorca ha sido seleccionado por la Fundación La Caixa en su convocatoria de Investigación en Salud 2020

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Hackathon virtual para buscar respuestas al COVID19

Con el objetivo de buscar respuestas y posibles soluciones a los distintos problemas y retos sanitarios, sociales y económicos planteados por el COVID-19, la Consejería de Ciencia, Universidades e Innovación de la Comunidad de Madrid impulsa la celebración de un encuentro online los próximos 4 y 5 de abril entre investigadores, universitarios, profesionales innovadores y sociedad civil en general.

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3ª Reunión científica en el CNIO

El pasado 4 de marzo se celebró en el departamento de Biología Estructural del CNIO una nueva reunión científica, a la que asistieron todos los miembros con cargo al proyecto y se hizo un resumen del progreso en las actividades científicas llevadas a cabo en las últimas semanas.

Double-stranded RNA bending by AU-tract sequences

Alberto Marin-Gonzalez, Clara Aicart-Ramos, Mikel Marin-Baquero, Alejandro Martín-González, Maarit Suomalainen, Abhilash Kannan, J. G. Vilhena, Urs F. Greber, Fernando Moreno-Herrero and Rubén Pérez.

Abstract: Sequence-dependent structural deformations of the DNA double helix (dsDNA) have been extensively studied, where adenine tracts (A-tracts) provide a striking example for global bending in the molecule. In
contrast to dsDNA, much less is known about how the nucleotide sequence affects bending deformations of double-stranded RNA (dsRNA). Using all-atom microsecond long molecular dynamics simulations we found a sequence motif consisting of alternating adenines and uracils, or AU-tracts, that bend the dsRNA helix by locally compressing the major groove. We experimentally tested this prediction using atomic force microscopy (AFM) imaging of long dsRNA molecules containing phased AU-tracts. AFM images revealed a clear intrinsic bend in these AU-tracts molecules, as quantified by a significantly lower persistence length compared to dsRNA molecules of arbitrary sequence. The bent structure of AU-tracts here described might play a role in sequence-specific recognition of dsRNAs by dsRNA-interacting proteins or impact the folding of RNA into intricate tertiary and quaternary structures.

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2ª Reunión científica en el CNB

Tiene lugar en el CNB la segunda reunión científica dentro del programa NanoBioCancer-CM. La agenda del día se centra en discutir a cerca de los resultados obtenidos y el estado del proyecto.

Fecha de la próxima reunión: 4 de marzo, en el CNIO.