3ª Reunión científica en el CNIO
El pasado 4 de marzo se celebró en el departamento de Biología Estructural del CNIO una nueva reunión científica, a la que asistieron todos los miembros con cargo al proyecto y se hizo un resumen del progreso en las actividades científicas llevadas a cabo en las últimas semanas.
Double-stranded RNA bending by AU-tract sequences
Alberto Marin-Gonzalez, Clara Aicart-Ramos, Mikel Marin-Baquero, Alejandro Martín-González, Maarit Suomalainen, Abhilash Kannan, J. G. Vilhena, Urs F. Greber, Fernando Moreno-Herrero and Rubén Pérez.
Abstract: Sequence-dependent structural deformations of the DNA double helix (dsDNA) have been extensively studied, where adenine tracts (A-tracts) provide a striking example for global bending in the molecule. In
contrast to dsDNA, much less is known about how the nucleotide sequence affects bending deformations of double-stranded RNA (dsRNA). Using all-atom microsecond long molecular dynamics simulations we found a sequence motif consisting of alternating adenines and uracils, or AU-tracts, that bend the dsRNA helix by locally compressing the major groove. We experimentally tested this prediction using atomic force microscopy (AFM) imaging of long dsRNA molecules containing phased AU-tracts. AFM images revealed a clear intrinsic bend in these AU-tracts molecules, as quantified by a significantly lower persistence length compared to dsRNA molecules of arbitrary sequence. The bent structure of AU-tracts here described might play a role in sequence-specific recognition of dsRNAs by dsRNA-interacting proteins or impact the folding of RNA into intricate tertiary and quaternary structures.
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2ª Reunión científica en el CNB
Tiene lugar en el CNB la segunda reunión científica dentro del programa NanoBioCancer-CM. La agenda del día se centra en discutir a cerca de los resultados obtenidos y el estado del proyecto.
Fecha de la próxima reunión: 4 de marzo, en el CNIO.
Reunión científica en el CNIO
Tiene lugar en el CNIO la primera de las reuniones científicas que se planean realizar con regularidad para discutir sobre resultados y estado del proyecto. Tras la presentación de los avances en sus proyectos de investigación dentro del programa NanoBioCancer de los investigadores Javier Coloma Cervera y Ángel Rivera Calzada, se discuten diferentes estrategias para la continuación y el cumplimiento de los objetivos propuestos.
Propuesta ERC-Synergy envíada
Los integrantes del consorcio NanoBioCancer han presentado una propuesta de proyecto para las subvenciones “Synergy Grants” del Consejo Europeo de Investigación (ERC). Para ello, Oscar Llorca y Fernando Moreno-Herrero han hecho equipo con otros dos investigadores principales europeos de gran relevancia en sus campos de investigación: Antonin Morillon (Institut Curie, Paris) y Janusz Bujnicki (International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsow).
Continue ReadingArchitecture of the mycobacterial type VII secretion system
Publicación en la prestigiosa revista Nature del grupo de Oscar Llorca
Continue ReadingViaje a Paris para trabajar en la ERC-Synergy
Oscar Llorca y Fernando Moreno se trasladan a Paris para reunirse con los otros dos jefes investigadores que forman el consorcio de la propuesta ERC Synergy. Lugar de la reunión: Institut Curie (Paris).
Reunión en el Centro Nacional de Biotecnología
Reunión @CNB para terminar la preparación de la propuesta ERC Synergy, documento B2, en la que trabajarán en París conjuntamente los 4 PIs del consorcio formado para la misma.
2ª Reunión del Comité de Gestión
Primera reunión del comité de gestión con Ana García del Arco como técnica de gestión del proyecto. El dia 12 de septiembre de 2019 se reúnen en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas Carlos III a las 9.15 los dos grupos que forman el consorcio NanoBiocancer. Como primer punto del orden del día se procede a discutir la estrategia de preparación de la propuesta para la ERC Synergy para la convocatoria del 5 de noviembre de 2019.